南通港航EDI系统是面向南通各港航单位、外贸及交通运输企业的公共信息平台和信息交换网络，并与上海口岸物流信息系统互联互通。该项目于2004年9月正式启动，2005年11月初步建成投入试运行。该系统包含数据传输和增值服务两大服务功能。

　　据验收组专家介绍，该系统对业务数据能够一次性录入，提高了工作质量，特别是在集装箱运输快速通关方面起到很好的作用，该项目系统平台所选择的硬件和软件系统均为目前国内主流产品，提供的增值服务及时、实用，系统与海关、海事、检验检疫等口岸查验单位联网运行，并与上海口岸实现信息共享。